가정을 꾸려 행복하게 살던 제이크와 네이티리는 판도라의 지역들을 탐험하기 위해 집을 떠나야 할 상황에 처한다. 한편, 곧 인간들이 기습해 또다시 판도라에 위협을 가하자, 제이크는 자신의 동족들과 불편한 전쟁을 치르게 된다.